Они думают, что добрые, в надежде на славную посмертную жизнь, сделаются еще лучшими; злые же будут стараться обуздать себя из страха перед тем, что если даже их грехи останутся скрытыми при жизни, то, по уходе в другой мир, они должны будут терпеть вечные муки. Этим своим учением о душе ессеи неотразимым образом привлекают к себе всех, которые только раз вкусили их мудрость» (Флавий, Иуд. война, II, 8, 11). Неотъемлемой частью ессейских воззрений являлась и абсолютная вера в предопределение. Они считали, что все в нашем мире уже заранее решено, поэтому у человека нет свободы воли. Флавий подчеркивал, что «учение ессеев требует все предоставлять на волю Божию» (Флавий, Иуд. война, II, 8, 3). Подобно фарисеям, многие ессеи слыли знатоками библейских книг, а некоторые из них даже прославились способностями к предсказанию будущего. Как утверждает Флавий, «встречаются между ними и такие, которые после долгого упражнения в священных книгах, разных обрядах очищения и изречениях пророков утверждают, что умеют предвещать будущее. И, действительно, редко до сих пор случалось, чтобы они ошибались в своих предсказаниях» (Флавий, Иуд. война, II, 8, 12). Из книг Флавия известно, например, о ессее Менахеме, который предсказал Ироду его восхождение на престол, а также о ессее Симоне, сумевшем правильно истолковать сон Архелая, сына Ирода, о том, сколько лет продлится его правление.
Ессеи не признавали авторитета храмовых священников и были не согласны с тем, как они управляли Храмом и вели там службу. Во-первых, как нам сегодня известно из Кумранских рукописей, некоторые лидеры ессеев происходили из знатных ааронидов и по крайней мере один из них был незаконно обойден при назначении на пост первосвященника. С тех пор ессеи считали, что истинные аарониды отстранены от службы в Храме, и не признавали полномочий первосвященников вообще. Во-вторых, они, подобно фарисеям, в корне расходились с саддукеями в вопросах толкования законов Письменной Торы. И, наконец, в третьих, ессеи возражали против слишком большой роли, которую играли в Храме жертвоприношения. Они отказывались приносить какие-либо жертвоприношения вообще, хотя делали денежные пожертвования Иерусалимскому Храму. Флавий сообщал по этому поводу следующее: «В храм они доставляют пожертвования. Но сами они не занимаются жертвоприношениями, считая другие способы очищения человека более целесообразными. Поэтому им запрещен доступ в общий храм и они совершают свое богослужение отдельно» (Флавий, Иуд. война, II, 8, 3).
Особый интерес представляют взаимоотношения ессеев и первых христиан. Как известно, Евангелия полны критики по поводу саддукеев и особенно фарисеев.