По ходу повествования мы наблюдаем переход власти от стареющего Вито к Майклу: после гибели Сонни его назначают исполняющим обязанности дона. Фредо, который слишком слаб, чтобы быть боссом, отправляется в Вегас, чтобы изучить там бизнес казино. Вито выздоравливает после покушения, но через короткое время умирает от сердечного приступа. И тогда Майкл, действуя быстро и решительно, пока семья Корлеоне еще сильна, казнит боссов-конкурентов и получает прозвище Крестный отец.
Эта «коронация» Майкла трагична главным образом потому, что Вито возлагал на него большие надежды совсем другого профиля. Он рассчитывал, что Майкл выучится и осуществит его мечту – сделает их семейный бизнес легальным. Вито изначально не планировал становиться преступником, просто ему в какой-то момент показалось, что для бедного сицилийского иммигранта это был единственный реальный шанс не стать марионеткой, пляшущей по прихоти других, а получить возможность самостоятельно распоряжаться своей судьбой. Самому стать тем, кто дергает за ниточки. И его заветной мечтой было увидеть Майкла сенатором или губернатором штата. В последнем разговоре с отцом Майкл говорит ему: «Все еще будет. Все будет». Майкл – воплощенная метафора Америки тех лет, страны молодой и перспективной, но теряющей свою душу.
Сюжет фильма «Крестный отец 2» разворачивается в конце 1950-х годов. Майкл перевез семью в Рино, штат Невада, где он активно развивает индустрию казино. У них несколько домов в великолепном поместье с видом на озеро Тахо. Майкл и его жена Кей растят сына и дочь. При этом Кей ежедневно напоминает ему о данном им обещании сделать семейный бизнес законным.
Параллельно в фильме развивается другая сюжетная линия, повествующая о начале «карьеры» отца Майкла, Вито Корлеоне, и мы можем одновременно наблюдать за обоими мужчинами, отцом и сыном, которые, находясь в одном возрасте, но живя в разное время, вовсе не одинаковым образом проявляют заботу о семье. Я не собираюсь здесь распространяться о сюжетной линии, касающейся Вито, отмечу лишь, что Америка на рубеже двадцатого века была более простым и менее безжалостным местом. Верный своим ценностям, Вито проводит много времени со своей семьей. В одной трогательной сцене он наблюдает, как его жена удерживает больного плачущего малыша Фредо, пока другая женщина ставит ему банки. Вито настолько жалко его, что кажется, будто ему самому еще хуже, чем бедняге Фредо. На протяжении всего фильма его любовь и преданность семье противопоставляются поведению Майкла и его отчужденности.
Майкл планирует заключить важную сделку с другим преступником-тяжеловесом, старым соратником Вито по имени Хайман Рот.