Маленкова, который, как известно, ещё со времён войны курировал работу всей авиапромышленности страны, а также на главкома сухопутных войск, заместителя министра Вооружённых сил СССР маршала Г.К. Жукова, на которого главный маршал авиации А.А. Новиков дал признательные показания о подготовке им военного переворота. Чуть позже, уже в ходе детального расследования знаменитого «трофейного дела» в 1946–1948 гг., были арестованы несколько десятков генералов и старших офицеров Группы Советских войск в Германии, в том числе близкие к Г.К. Жукову генерал-лейтенанты К.Ф. Телегин и В.В. Крюков, вполне правомерно обвинённые в нецелевой растрате армейских фондов и вывозе с оккупированных территорий огромного количества дорогостоящей старинной мебели, картин кисти знаменитых европейских живописцев, гобеленов, столового серебра и драгоценностей.
Между тем в начале июня 1946 г. состоялся разбор «дела Жукова» на заседании Высшего военного совета, в котором приняли участие все члены Политбюро и высший генералитет страны. Обвинения против главкома сухопутных войск поддержали ряд членов Политбюро, в том числе В.М. Молотов, Г.М. Маленков и А.А. Жданов, и особо активно — начальник Главного управления кадров и зам. главы военного ведомства страны генерал-полковник Ф.И. Голиков. Однако целый ряд видных советских полководцев, в том числе маршалы Советского Союза Иван Степанович Конев, Александр Михайлович Василевский, Константин Константинович Рокоссовский, Василий Данилович Соколовский и особенно маршал бронетанковых войск Павел Семёнович Рыбалко, отметив личные недостатки и тяжёлый характер маршала Г.К. Жукова, а также крупные ошибки в его работе, твёрдо заявили, что он является настоящим советским патриотом и не может быть организатором мифического «военного заговора». Тем не менее по итогам заседания маршал Г.К. Жуков, вполне правомерно обвинённый в потере личной скромности, моральном разложении и непомерных амбициях, был снят со своих высоких постов и назначен с понижением командующим Одесским военным округом.
Как известно, уже в начале августа 1946 г. произошла новая перегруппировка сил в верхних эшелонах власти, связанная с тем, что: 1) новым заместителем председателя Совета Министров СССР, членом его Бюро и заместителем руководителя Оперативного бюро СМ СССР, главой которого являлся Л.П. Берия, был утверждён глава Спецкомитета по ракетной технике (2-го Спецкомитета) Г.М.