Например, среди 588 индейцев во всех трех основных языковых категориях – алеуто-эскимосская, надене и америндская – на гаплогруппу Q приходилось 76 % от всех, на гаплогруппу R – 13 %, на гаплогруппу С – 6 %. Остальные 5 % – прочие, минорные гаплогруппы.
Интерпретации, в основном, сводятся к тому, что эти неаборигенные гаплогруппы принесены в среду американских индейцев после 1492 года, то есть после открытия Америки Колумбом, и среди ранних «забросов» – обитателями «пропавшей колонии» в Роаноке, нынешняя Северная Каролина, которые высадились числом более ста человек в 1587 году, и через три года бесследно пропали – или все погибли, или были ассимилированы индейцами. Некоторые публикации в общих терминах упоминают, что были возможны и более ранние контакты аборигенов с европейцами, но никто ничего конкретного не приводит.
И вот оказалось, что в 16 обследованных индейских популяциях, которые считали себя или «чистыми» индейцами, или, по меньшей мере, на три четверти (но по материнской линии, отцовские были индейскими), 47 % семей имели европейские или африканские гаплогруппы. В 26 индейских популяциях северо-востока Канады доля неаборигенных Y-хромосом выявлена у 88 % семей. Авторы предположили, что были ранние контакты этих племен с европейцами, причем «ранние» – это до 1780 года, до времени заселения европейцами тех мест. По данным тех же авторов, среднее содержание гаплогруппы R1b у американских индейцев составляет 73 %. Дальше опять идут интерпретации, которые варьируются в широких пределах – от тех, по которым у многих индейских племен было актом гостеприимства «выдавать» визитеру-европейцу «жену на ночь», и родившихся детей племя воспитывало, полностью принимая за своих, и до ранних, пре-колумбовых контактов американских индейцев с европейцами.
В племени Lumbee, которое является наиболее «подозреваемым» в ассимиляции «пропавшей колонии» Роанока (и которое, видимо, и эволюционировало из индейского племени кроатоан, описанного членами «пропавшей колонии»), в составе гаплогрупп среди 396 протестированных мужчин доминирует R1b (61 %), на втором месте гаплогруппа I (15 %), на третьем E1b (8 %), на четвертом – R1a (3 %). Иначе говоря, аборигенных индейских гаплогрупп там практически нет, менее 4 %. Племя обитает на морском побережье Северной Каролины.
В Мексике почти исключительно гаплогруппа Q, а к северу ее доля постепенно падает. В Южной Америке среди аборигенов тоже большая доля гаплогруппы Q, причем очень древней, с общим предком примерно 16 тыс. лет назад. В юго-западной части США и в Мезоамерике, то есть на мексиканском перешейке, в 12 индейских племенах, включающих ацтеков, тарахумара, запотек, зуни и другие, была найдена почти исключительно гаплогруппа Q.