До конца 1953 года следствие по данному делу шло ни шатко ни валко, однако после ликвидации Л.П.Берии и его подельников это дело оказалось в центре внимания КГБ и Прокуратуры СССР, руководители которых буквально «рыли носом землю», чтобы максимально ускорить новый судебный процесс над сотрудниками спецслужб. Причём ряд исследователей (К.А. Столяров[277]) отмечают не только особую поспешность в проведении закрытого судебного процесса, проведённого в Ленинграде в декабре 1954 года, но и особую ретивость в исполнении смертного приговора в отношении В.С. Абакумова, который был расстрелян буквально через час после его оглашения. Более того, сам К. А. Столяров прямо говорит о том, что генерал-полковник В.С. Абакумов «был одним из немногих, кто знал обо всех злодеяниях власть имущих, в том числе и Хрущёва». И именно поэтому глава КГБ СССР генерал-полковник И.А. Серов «торопил всё следствие и пытался форсировать события», а его покровитель Н.С.Хрущёв «стремился как можно быстрее разделаться» с В.С. Абакумовым и его подельниками.
Между тем ещё до окончания этого дела, 14 октября 1954 года, ЦК КПСС и Совет Министров СССР приняли новое совместное Постановление «О существенных недостатках в структуре министерств и ведомств СССР и мерах по улучшению работы государственного аппарата». Констатирую тот факт, что с начала 1954 года в 46 министерствах и ведомствах страны упразднены 200 управлений и отделов, более 4 тысяч «мелких структурных подразделений», около 900 снабженческих организаций, уволены более 450 тысяч сотрудников различных аппаратов и т. д. Постановление нацеливало руководителей всех управленческих структур союзного масштаба ещё активнее вести работу по устранению «излишеств в штатах», изжить волокиту, разбухшую отчётность и до 1 февраля 1955 года представить в ЦК и Совет Министров СССР отчёт о проделанной работе[278]. Причём, что любопытно, в названии данного Постановления впервые за долгие годы ЦК КПСС был указан «поперёд» Совета Министров СССР, первой уже стояла подпись Н.С.Хрущёва, а не Г.М.Маленкова и речи об «оптимизации» партийного аппарата в этом документе вообще не шло.
Между тем, по информации ряда историков (Ю.В. Аксютин, А.В. Пыжиков[279]), уже с ноября 1954 года все документы Совета Министров СССР стали оформляться за подписью маршала Н.А. Булганина, занимавшего должность первого заместителя главы союзного правительства, а сам Г.М.Маленков был де-факто отстранён от ведения заседаний Президиума ЦК, на которых стал председательствовать Н.С.Хрущёв. А окончательный удар по позициям главы правительства был нанесён в декабре 1954 года, когда состоялся судебный процесс над В.С. Абакумовым и его подельниками, которых в том числе обвинили в фабрикации «Ленинградского дела», ведь за ней стоял не кто иной, как Г.М.