В Швецию Мария Элеонора вернулась только в 1644 г., когда Кристина стала независимой королевой и начала серьезно конфликтовать с канцлером Оксеншёрной. Мать и дочь жили душа в душу, умерла Мария Элеонора в 1655 г., менее чем через год после отречения Кристины.
На характере и образе жизни королевы Кристины сильно сказалось ее мужское воспитание. Еще Густав II Адольф стал растить дочь как сына – девочку одевали в мужские одежды, с двух лет посадили на коня, окружение у нее было исключительно мужское. В результате выросла чрезвычайно умная девица, предпочитавшая мужское общество, не терпевшая подле себя девиц, за исключением одной.
Аксель Оксеншёрна честно готовил Швеции достойную королеву, ежедневно обучая девочку искусству управления государством. Поговаривали, что канцлер намерен женить на Кристине собственного сына Эрика. Однако сватовство не состоялось, поскольку юная королева оказалась талантливой интриганкой и еще до своего совершеннолетия стала злейшим политическим врагом канцлера. Вокруг нее сложилась крепкая антиоксеншёрнинская партия. Канцлер полагал необходимым продолжать Тридцатилетнюю войну – Кристина настаивала на заключении мира, который и был подписан в октябре 1648 г.
Камнем преткновения между государыней и канцлером оказался вопрос о замужестве Кристины. Объявив себя поклонницей английской королевы Елизаветы I, строптивица выразила желание остаться вечной девой и отказалась выходить замуж. Впрочем, она не скрывала, что влюблена в свою придворную даму Эббу Спаре по прозванию Прекрасная Графиня – единственную женщину, допущенную в общество Кристины. Близкие отношения влюбленные поддерживали всю жизнь: когда Кристина отреклась от престола и уехала, между ними шла оживленная, полная страсти переписка.
У юной королевы было несколько фаворитов-мужчин, однако физической близости с кем-либо из них Кристина не имела (зато слухов о ее распутстве ходило предостаточно – возможно, их распускали по воле самой королевы). Особым доверием пользовался граф Магнус де ла Гарди. Королева прочила его на место Акселя Оксеншёрны. Но старый интриган обхитрил свою подопечную и от имени Госсовета выпроводил соперника с дипмиссией в Париж. Кристина отомстила: к Прекрасной Графине сватался влюбленный в нее сын канцлера Бенгт Оксеншёрна, королева же выдала свою любимицу за младшего брата Магнуса – Якоба де ла Гарди.
У династии Ваза, последней представительницей которой на шведском престоле была Кристина, имелась боковая ветвь по тетке королевы Катарине Ваза – родной сестре Густава II Адольфа. Вопреки протестам Акселя Оксеншёрны (канцлер враждовал с родичами королевы) Кристина добилась от рикстага назначения ее наследником старшего сына Катарины – Карла Густава Пфальц-Цвейбрюкена.