Всего затребовали на расправу 20 человек, в их числе Матвеева и семерых Нарышкиных. Матвеева здесь же сбросили с Красного крыльца на копья, а затем изрубили бердышами. Царица, царевичи и придворные разбежались по палатам. Царицу и ее родственников спрятала вдовствующая царица Марфа Матвеевна. Она же помогла двум братьям Натальи Кирилловны бежать из Кремля и Москвы."
"Убийства сторонников Нарышкиных продолжались несколько дней. Старший брат царицы Иван Нарышкин сдался стрельцам сам, чтобы спасти сестру и племянника. Его долго пытали, принуждая сознаться в намерении убить царевича Ивана, но, ничего не добившись, выволокли полуживого на Красную площадь, разрубили на куски и выставили останки казненного на обзор в разных концах города.
Бунт кончился 20 мая. Правительства Натальи Кирилловны более не существовало. По требованию стрельцов 26 мая были объявлены два царя: первым – Иван V, вторым – Петр I. Власть же перешла в руки царевен – дочерей Милославской. Царевна Софья стала регентом при малолетних братьях.
Однако во главе стрельцов стоял боярин-старовер Иван Хованский. Он и подстрекнул стрельцов-раскольников потребовать от патриарха и иерархов церкви разъяснений, почему они отменили старую веру и перешли в латинство?
Чтобы предотвратить новый бунт, патриарх назначил на 5 июля церковный собор, на котором намеревался отстоять реформы Никона. Хованский рассчитывал запугать Иоакима и отменить реформы. Но перед лицом общей опасности женщины кланов Дома Романовых временно объединились: было объявлено, что они тоже будут участвовать в соборе.
По настоянию Софьи заседали в Грановитой палате. Патриарх шел на собор в уверенности, что стрельцы всех их перебьют. От царствующей фамилии явились царевны-сестры Софья и Мария, их тетка Татьяна Михайловна и царица Наталья Кирилловна. Женщины намеревались в случае опасности защитить своим присутствием патриарха и иерархов.
Хованский пустил на собор только стрельцов, горожан же велел гнать. Долгий диспут был скандальным – чуть не началась драка между спорившими – и окончился ничем. Впрочем, староверы были уверены, что победили.
По окончании прений, когда все вышли во двор, Софья приказала выставить стрельцам по ушату водки на десятерых, после чего пьяная компания, подстрекаемая агентами Милославских, похватала староверческих монахов, а их главарю Никите Пустосвяту отрубили голову. Хованский не смог помочь своим подручным. Наоборот, он стал потворствовать стрельцам, поскольку иной опоры у него уже не было.
20 августа Софья с царями неожиданно уехала из Москвы. Месяц они разъезжали по Подмосковью, якобы для богомолья. 18 сентября на именины царевны съехались в село Воздвиженское бояре.