Командующий 1-м воздушным флотом генерал-полковник Альфред Келлер получил директиву германского Верховного командования: «Сорвать эвакуацию Ленинграда всеми средствами и не дать противнику возможности улучшения продовольственного положения и тем самым обороноспособности Ленинграда». Суровая зима задержала начало навигации, и первый корабль прошел через Ладожское озеро только 22 мая. Менее чем через неделю начались удары вражеской авиации, которые были встречены шквальным огнем зенитных пушек и пулеметов, в воздух поднимались истребители. На каждой барже вскоре был установлен крупнокалиберный зенитный пулемет. Командир дивизиона канонерских лодок капитана 1 ранга Н.Ю. Озаровский записал в своем дневнике: «28 мая 1942 г. Неожиданно налетели вражеские самолеты и начали бомбить порт. Корабли открыли огонь. Фашистские самолеты Ю-88 сбрасывали бомбы с пикирования или с горизонтального полета на высоте 200-300 метров Несколько снарядов разорвалось в фюзеляже бомбардировщика. Под углом 70 градусов «Юнкерс» врезался в землю на отмели». Противовоздушная оборона на Ладожском озере оказалась достаточно эффективной – потери грузов от ударов с воздуха составили менее 1 % от всего объема перевозок.
Однако не менее серьезной была угроза с воды. Финский флот был слаб, поэтому в июне 1942 года на Ладожское озеро были перевезены итальянские торпедные катера. Четырем катерам типа MAS («Motoscafo Anti Sommergibile») из состава 12-го отряда торпедных катеров для этого пришлось пропутешествовать через всю Европу. Также на Ладогу были переброшены немецкие вооруженные паромы «Зибель», предназначавшиеся для высадки десанта на Британские острова. Этот ход противника также был спрогнозирован советским командованием, и для него подготовили противоядие. Специальная авиационная группа Ставки Верховного Главнокомандования обрушила на базы вражеских катеров и паромов град бомб. Вопреки ожиданиям, громких успехов итальянские моряки-катерники на Ладоге не добились. Атакующие катера встречал плотный огонь сопровождавших караваны боевых кораблей Ладожской флотилии. Кроме того, мелкосидящие буксиры и баржи были трудной целью. Итальянские «угри» – торпеды – попросту проходили у них под днищем.
Апофеозом борьбы за коммуникации на Ладоге стал бой за остров Сухо. Это был искусственный остров с маяком к северу от устья реки Волхов. Немецким и финским командованием была спланирована операция под кодовым наименованием «Бразиль». План операции предусматривал десант на остров с разрушением маяка, захватом шифров и минированием подходов к острову. Это был бы чувствительный удар по перевозкам. Рано утром 22 октября 1942 года остров был атакован бомбардировщиками, а вслед за авиаударом на остров высадился вражеский десант.