Первым узнал он и о подготовке генералом государственного мятежа, и сразу перешел на сторону заговорщиков.
Переворот 9 ноября 1799 г., который официально признан историками как финальная точка в революции, Фуше «проспал» и очень «удивился», когда ему сообщили о случившемся. Наполеон и Фуше всем в карьере были обязаны Баррасу, но именно Барраса они и свергли.
Едва Наполеон захватил власть, началась борьба между его семьей – матерью, братьями и сестрами – и союзом Жозефины с Фуше. Клан Бонапартов требовал от Наполеона коронации и монархии, Жозефина и Фуше были против.
Вечером 24 декабря 1800 г. монархисты попытались взорвать карету с Наполеоном, уже ставшим к тому времени консулом. Фуше за две недели раскрыл заговор и арестовал его организаторов. Казалось бы, авторитет его у Наполеона должен был возрасти, но тогда же консулу донесли, что министр в тайном общении с сановниками уверял их, будто Наполеон – убежденный республиканец и никогда не примет корону. Во избежание скандала, в сентябре 1802 г. консул упразднил министерство полиции, а Фуше возвел в сенаторы, дав ему в придачу маленькое княжество Экс, и удалил от себя.
Интриган потребовался вновь лишь в 1804 г. Именно Фуше поручил Наполеон подготовку сановников к возведению его в императоры. Фуше немедля переметнулся на сторону консула, предав Жозефину. Он буквально выкручивал руки сенаторам, пока те не объявили жизненно необходимым короновать Наполеона императором! Петицию об этом написал сам Фуше, за что и получил обратно министерство полиции.
С этого времени Наполеон оказался под колпаком у Фуше. Министр отслеживал каждый его шаг, все его дела – от личных финансовых до постельных.
Сразу после развода императора с Жозефиной и его женитьбы на Марии Луизе зоркий Фуше понял, что править Наполеону недолго, а потому поспешил вступить в тайные переговоры о власти одновременно с Людовиком XVIII, со скрытыми якобинцами и с английским правительством. Однако за министром следили шпионы Наполеона. Хотя за этими шпионами уже следили шпионы Фуше, первым все же удалось разузнать и донести императору подробности этих переговоров. В 1810 г. министра полиции вновь спровадили в отставку. К этому времени Фуше уже был герцогом Отрантским – герб герцогу был дан отменный: в центре поля стоит отлитый из золота столб, вокруг которого обвивается змея."
"В начале 1813 г. Наполеон вернулся после катастрофы в России. Новая военная кампания завершилась еще большей катастрофой – в «битве народов» под Лейпцигом, длившейся с 16 по 19 октября 1813 г., император потерпел сокрушительное поражение от войск 6 й коалиции – России, Австрии, Пруссии и Швеции. Еще по пути в Париж Наполеон вспомнил о Фуше и его пристрастии к заговорам, и искренне испугался переворота.